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Ce contrôle final de la matière 2 du module Biotechnologies et Amélioration des Plantes comporte 2 sujets se rapportant au cours (+ TD) et travaux pratiques (TP), Faculté des Sciences, Université Cadi Ayyad, Marrakech, Morocco. Cette évaluation (QCM) concerne les marqueurs de types isoenzymes et PCR (RAPD) appliqués au sésame et au palmier dattier
- EXAMEN SUR LE COURS
- EXAMEN SUR LES TRAVAUX PRATIQUES (TP)
UNIVERSITE CADI AYYAD جامعة القاضي عياض
FACULTE DES SCIENCES SEMLALIA كلية العلوم السملالية
Contrôle final écrit de la Matière 2 (Marqueurs moléculaires et Amélioration des Plantes) du Module Biotechnologie et amélioration des plantes, Semestre 6, Option BAPV, Septembre 2020 (durée: 40 minutes). Pondération: 65% de la note globale du contrôle écrit du Module.
SUJET DE L'ECRIT (temps: 40 min, note/13):
Afin d'introduire la résistance à la phyllodie dans le sésame (Sesame, سمسم , جلجلان), Parani et al. (1997, Indian J. Genet 57) ont effectué une hybridation interspécifique via la culture d'ovules, réalisée entre les espèces de sésame; Sesamum indicum L. (espèce sensible, parent male, M) et Sesamum alatum Thonn., espèce sauvage résistante à la phyllodie, utilisée comme parent femelle (F).
Pour vérifier l'hybridation, les auteurs ont utilisé des marqueurs de type RAPD basés sur la PCR. La purification de l'ADN a été réalisée à partir des feuilles de sésame prélevées à partir de plantes male (M), Hybride (H) et femelle (F). L'amplification des ADN par la PCR a été réalisée suivant un programme constitué d'une dénaturation initiale à 94°C pendant 3 min, suivie par 45 cycles de 1 min à 94°C, 1 min à 40°C, 2 min à 72°C. Le programme est terminé par une élongation finale de 10 min à 72°C et une conservation des amplifiats à 4°C. L'électrophorèse des amplifiats d'ADN a été réalisée sur des gels à 1,3% (p/v) en agarose, avec une révélation par le bromure d'éthidium. Les résultats obtenus sont résumés dans la figure suivante.
Remplissez les cases vides. Ecrire aux majuscules, attention aux fautes d'orthographe et respecter les espaces.Le polymorphisme de type RAPD datant d'environ: [........]. (choix : 1950; 1960 ; 1980 ; 1989 ; 1992), est basé sur les mutations d'ADN affectant le(s) [......................]. (choix : SITES DE RESTRICTION DES ENDONUCLEASES; SITES DE LA TAQ POLYMERASE; SITES DE FIXATION DES AMORCES ; REPETITION DE SEQUENCES NUCLEOTIDIQUES ; SIMPLE NUCLEOTIDE).
Dans le cycle PCR de la RAPD, le chauffage 1 min à 40°C correspond à l'étape : [................] (choix : DENATURATION ; APPARIEMENT ; ELONGATION ; STABILISATION, TERMINAISON).
La RAPD génère des marqueurs qualifiés de: [.............] (choix : STABLES ; DOMINANTS ; CODOMINANTS ; RARES ; CIBLES DE L'ARN) et de reproductibilité [..........](choix : FAIBLE ; PARFAITE).
Concernant l'électrophorégramme des RAPD, l'amorce OPF10 génère [......] fragment(s) d'ADN spécifique(s) du (des) de Sesamum altum (parent femelle, F) (choix: 1; 2; 3; 4; 5).
L'amorce OPA5 peut être utilisée dans l'dentification de l'hybride (H) grâce à la présence/absence des bandes comptées [..........] à partir de la cathode (choix : 1 et 2 ; 2 et 3 ; 3 et 4 ; 1, 2 et 3 ; 4 et 5).")
L'amorce OPF15 peut être utilisée dans l'dentification de l'hybride (H) grâce à la présence/absence des bandes comptées [..........]. à partir de la cathode (choix : 1 et 2 ; 3 et 4 ; 4 et 5 ; 5 et 6 ; 6 et 7).")
La(es) amorce(s) qui ne peut(vent) être utilisée(s) dans l'identification des hybrides S. alatum x S. indicum est (sont) [...........] (choix : OPA2 ; OPA2 et OPA5; OPF8 et OPF10; OPA2 ET OPF8; OPA20; OPF16), car elle(s) risque(nt) de faire une confusion entre le parent femelle (F).
L'amorce qui risque de faire une confusion entre le parent mâle et l'hybride est [.........] (choix : OPA2 ; OPA16; OPA17; OPF8; OPA20; OPF16).
SUJET des Travaux Pratiques (temps: 20 min, note/7):
Le marquage moléculaire de type ‘isoenzymes' a été utilisé pour l'amélioration génétique de palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) au Maroc (Bendiab, K., Baaziz, M. & Majourhat, K., 1998. Biochemical Systematics and Ecology 26, 71-82). Une population F1 de jeunes plants de palmier dattier, a été obtenue à partir d'un lot de graines provenant du croisement dirigé entre un mâle inconnu (Y) et ‘Iklane' (IKL) comme cultivar (palmier femelle). L'électrophorèse (gel de polyacrylamide 11% à pH 8,8) des isoenzymes des transaminases de type glutamate oxaloacétate transaminase (GOT) a été réalisée à partir d'extraits enzymatiques de feuilles. Elle a permis d'obtenir 7 phénotypes électrophorétiques notés A, B, C, D, E, F et G. Un locus bien distingué GOT-2 a été mis en évidence (voir figure).
Le cultivar IKL a montré le phénotype électrophorétique A. Les palmiers mâles, M-1 et M-2, fréquemment utilisés dans la pollinisation présentent, respectivement, les phénotypes E et A. Les fréquences des phénotypes isoenzymatiques de la population F1 de jeunes plants sont A (29%), B (20%), C (19%), D (32%), E (0%) et G (0%).
Répondez aux questions posées en remplissant les cases vides. Ecrire aux majuscules, attention aux fautes d'orthographe et respecter les espaces. Pénalité pour toute réponse incorrecte: 10%.
Un volume de 6 mL d'une solution mère de polyacrylamide de concentration [........] est suffisant pour préparer 15 mL du gel de polyacrylamide 11%, utile pour l'électrophorèse des GOT.
Par rapport au pH 8,8, le PI des GOT est : [...........] (choix: ACIDE , BASIQUE, IDENTIQUE).
Si le pH du gel était fixé à un pH inférieur au PI des GOT, l'électrophorèse verticale (Dépôt à la cathode, anode en bas du gel), aurait montré un nombre maximal d'isoenzymes égal à : [......] (choix: 0, 1, 2, 3, 5, 4, 6). En effet, leur charge électrique serait [..............] (choix: POSITIVE; NEGATIVE)");
rep("Si le pH du gel était fixé à un pH inférieur au PI des GOT, l'électrophorèse verticale (Dépôt à l'anode, cathode en bas du gel), aurait montré un nombre maximal d'isoenzymes égal à : [6] (choix: (0, 1, 2, 3, 5, 4, 6).
Le zymogramme montre que les isoenzymes de la zone GOT-2 sont sous le contrôle de [......] allèles (choix: 2, 3, 4).
Pour le cas des enzymes dimériques à 3 allèles, les 'hétérozygotes montrent [......] (chpoix: 2, 3, 4, 5) bandes.
Le pourcentage du génotype Got-2 BB dans la population F1 est: [51] (choix: 19, 20, 29, 32, 49, 51).
Sachant que les allèles mis en jeu sont transmis selon la loi de Mendel, le génotypes Got-2 du parent mâle (Y) de la population F1 est: [........] (choix: AA, BB, AB).
Le palmier mâle (Y) utilisé dans le croisement est: [.........](choix: M-1, M-2, AUTRE).
L'une des raisons derrière le non usage des marqueurs RAPD dans cette étude, serait la [...........] (choix: ALTERATION, CODOMINANCE, DOMINANCE, NON-REPRODUCTIBILITE) de ces marqueurs.
- Marqueurs Moléculaires:
- TECHNIQUES D'ANALYSE ET DE SEPARATION. ELECTROPHORESE (QCM)
- ELECTROPHORESE et TYPES DE MARQUEURS MOLECULAIRES (QCM)
- MARQUEURS MOLECULAIRES ET BIOTECHNOLOGIES DES PLANTES
- ISOENZYMES. INTERPRETATION DES ZYMOGRAMMES ET APPLICATIONS (QCM)
- GENETIC DIVERSITY AND MOLECULAR MARKERS AS TOOLS. MASTER DEGREE. BLANK QUIZ
المؤشرات الجزيئية، أدوات لدراسة التنوع الوراثي
- QUIZ FORMATIF CONTROLE SUR LES BIOTECHNOLOGIES DES PLANTES
إختبار توجيهي للمعرفة في موضوع بيوتكنولوجيات النبات
- ISOENZYMES. Préparation d'extraits enzymatiques (TP)
- ISOENZYMES (TP). Fichier pdf
- Isoenzymes (TD). QCM formatif
- Marqueurs moléculaires. QCM formatif
- Purification de l'ADN pour les marqueurs moléculaires RFLP et PCR
- Electrophorèse. Techniques (cours)
- Marqueurs isoenzymatiques (cours)
- Marqueurs RFLP (RFLP. Fichier pdf)
- Marqueurs basés sur la PCR:
--> Marqueurs
RAPD
--> RAPD (pdf)
--> Marqueurs
SSR ou Microsatellites (pdf)
--> Marqueurs AFLP
Contrôles :
- Examen final du Module (Contrôle blanc) du Moule Biotechnologies et Amélioration des Plantes (2020)
- controle final. Ecrit et Pratique (biotechnologies, sesame, isoenzymes)
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