L'évaluation
de la diversité génétique des ressources naturelles est un préalable indispensable à la définition des stratégies de leur gestion ou leur amélioration génétique. La diversité génétique est liée au polymorphisme montré par les espèces.
Les informations obtenues au niveau phénotypique sont souvent difficiles à interpréter, car, il s'agit de variations continues où de nombreux gènes peuvent y être impliqués.
Les marqueurs génétiques de types protéique, enzymatique ou nucléiques, dont l'expression est indépendante de l'environnement peuvent être utilisés pour caractériser les populations
et évaluer leur diversité génétique aux niveaux intra- et inter-populations.
Les
marqueurs biochimiques et Moléculaires sont des protéines ou des séquences de DNA facilement détectables et transmissibles génétiquement. Ils résultent d'un polymorphisme pouvant être utilisé dans l'étude de la diversité génétique.
Marqueurs moléculaires. Historique
Différents types de polymorphismes
1/ Polymorphisme des protéines.
- Polymorphisme des protéines de réserve.
- Polymorphisme enzymatique (isoenzymes).
2/ Polymorphisme de l'ADN (Acide désoxyribonucléique, DNA).
Les DNA nucléaire et cytoplasmique (DNA des chloroplastes (cpDNA)
et le DNA mitochondrial (mtDNA)) peuvent être étudiés
pour leur polymorphisme. Les cpDNA et mtDNA sont de taille plus faible
par rapport à celle du DNA nucléaire. Cependant, ils existent
sous forme de plusieurs copies dans une cellule et sont généralement
transmis maternellement.
Polymorphisme
basé sur la restriction de l'ADN.
Polymorphisme détecté par les marqueurs
moléculaires de type 'RFLP'
Polymorphisme basé sur la polymérisation en chaîne de l'ADN (PCR):
- Polymorphisme détecté par les marqueurs
moléculaires de type RAPD
- Polymorphisme détecté par les marqueurs
de type microsatellites (SSR)
Polymorphisme basé sur la restriction de l'ADN et la PCR.
Polymorphisme détecté par les marqueurs
de type AFLP
Polymorphisme détecté par d'autres techniques
Video 'genetic diversity through molecular markers' (master level, Cadi Ayyad University, 2019:
Qualités d'un bon marqueur moléculaire
- Polymorphe.
- Transmis de façon codominante.
- Facile à obtenir.
- Reproductible.
Aucun marqueur ne possède toutes les qualités requises
Localisation des marqueurs moléculaires
Moyens de détection des marqueurs
L'électrophorèse est une méthode d'analyse et de séparation basée
sur les critères de la chargeélectrique et la taille des
molécules. La migration différentielle de particules chargées
électriquement, se fait sous l'influence d'un champs électrique.
Seules les particules chargées positivement ou négativement
sont attirées par les pôles opposés du champs électrique.
Les composés qui peuvent être transformés en particules
chargées par formation de complexes, sont de même sujets à une migration sous l'effet du champs électrique.
Les marqueurs moléculaires obtenus par électrophorèse
sont d'un grand intérêt dans la sélection
des plantes (MAS ou 'Marker Assisted Selection'). Ils servent aussi
pour l'étude de la structuration de la diversité génétique.
Comme exemple, l'étude de la diversité
génétique du palmier dattier en utilisant le programme
Biosys-1.
Biodiversité et diversité génétique. Articles généraux:
- Biotechnologies. Définition et impact sur la biodiversité (Les biotechnologies
ou technologies du vivant englobent un ensemble de méthodes et techniques...)
L'etude des biotechnologies modernes necessitent une base de connaissances
dans les techniques d'analyse
utilisées dans l'investigation des genes et des proteines.
Il s'agit en particulier des techniques d'electrophorese
sur gels d'agarose et de polyacrylamide. Le marquage
biochimique et moleculaire reste un préalable important pour le
développement des applications en biotechnologies et le suivi des impacts
éventuels sur la biodiversité, la diversité génétique et l'environnement.
Le but ultime et de rassebler des atouts pout le développement durable.
- Sauver les palmiers au Maroc (les palmiers
dattiers au Maroc sont repartis en palmeraies...)
- Contraintes (stress) biotiques et abiotique
du palmier dattier(parmi les contraintes biotiques, le bayoud constitue ....)
- Le
charançon rouge. Une nouvelle menace pour le palmier dattier au Maghreb.
C'est sérieux, cette fois, la charançon rouge (Rhynchophorus
ferrugineus, red palm weevil) attaque les palmiers au nord du Maroc.
- Biodiversité.
Espèces menacées de disparition (rapport UICN 2009)
- OGM.
Avantages et/ou inconvénients
-/ Microbes
synthétiques pour sauver l'environnement ?
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