Biotechnologies

Etude de la diversité génétique et du polymorphisme par les marqueurs
دراسة التنوع الوراثي بالمؤشرات الوراثية
Studies on genetic diversity through molecular markers


Evaluation de la diversité génétique
تقييم التنوع الوراثي

L'évaluation de la diversité génétique des ressources naturelles est un préalable indispensable à la définition des stratégies de leur gestion ou leur amélioration génétique. La diversité génétique est liée au polymorphisme montré par les espèces.
Les informations obtenues au niveau phénotypique sont souvent difficiles à interpréter, car, il s'agit de variations continues où de nombreux gènes peuvent y être impliqués. Les marqueurs génétiques de types protéique, enzymatique ou nucléiques, dont l'expression est indépendante de l'environnement peuvent être utilisés pour caractériser les populations et évaluer leur diversité génétique aux niveaux intra- et inter-populations.
Les marqueurs biochimiques et Moléculaires sont des protéines ou des séquences de DNA facilement détectables et transmissibles génétiquement. Ils résultent d'un polymorphisme pouvant être utilisé dans l'étude de la diversité génétique.


Marqueurs moléculaires. Historique


diversité génétique; Marqueurs

Différents types de polymorphismes


1/ Polymorphisme des protéines.
- Polymorphisme des protéines de réserve.
- Polymorphisme enzymatique (isoenzymes).
2/ Polymorphisme de l'ADN (Acide désoxyribonucléique, DNA).
Les DNA nucléaire et cytoplasmique (DNA des chloroplastes (cpDNA) et le DNA mitochondrial (mtDNA)) peuvent être étudiés pour leur polymorphisme. Les cpDNA et mtDNA sont de taille plus faible par rapport à celle du DNA nucléaire. Cependant, ils existent sous forme de plusieurs copies dans une cellule et sont généralement transmis maternellement.

Molecular markers

Polymorphisme basé sur la restriction de l'ADN.
Polymorphisme détecté par les marqueurs moléculaires de type 'RFLP'
Polymorphisme basé sur la polymérisation en chaîne de l'ADN (PCR):
- Polymorphisme détecté par les marqueurs moléculaires de type RAPD
- Polymorphisme détecté par les marqueurs de type microsatellites (SSR)
Polymorphisme basé sur la restriction de l'ADN et la PCR.
Polymorphisme détecté par les marqueurs de type AFLP
Polymorphisme détecté par d'autres techniques


Video 'genetic diversity through molecular markers' (master level, Cadi Ayyad University, 2019:



Qualités d'un bon marqueur moléculaire


- Polymorphe.
- Transmis de façon codominante.
- Facile à obtenir.
- Reproductible.
Aucun marqueur ne possède toutes les qualités requises


Localisation des marqueurs moléculaires


protéines, ADN

Moyens de détection des marqueurs


électrophorèse

L'électrophorèse est une méthode d'analyse et de séparation basée sur les critères de la chargeélectrique et la taille des molécules. La migration différentielle de particules chargées électriquement, se fait sous l'influence d'un champs électrique. Seules les particules chargées positivement ou négativement sont attirées par les pôles opposés du champs électrique. Les composés qui peuvent être transformés en particules chargées par formation de complexes, sont de même sujets à une migration sous l'effet du champs électrique.
Les marqueurs moléculaires obtenus par électrophorèse sont d'un grand intérêt dans la sélection des plantes (MAS ou 'Marker Assisted Selection'). Ils servent aussi pour l'étude de la structuration de la diversité génétique. Comme exemple, l'étude de la diversité génétique du palmier dattier en utilisant le programme Biosys-1.


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Biodiversité et diversité génétique. Articles généraux:


- Biotechnologies. Définition et impact sur la biodiversité (Les biotechnologies ou technologies du vivant englobent un ensemble de méthodes et techniques...)
L'etude des biotechnologies modernes necessitent une base de connaissances dans les techniques d'analyse utilisées dans l'investigation des genes et des proteines. Il s'agit en particulier des techniques d'electrophorese sur gels d'agarose et de polyacrylamide. Le marquage biochimique et moleculaire reste un préalable important pour le développement des applications en biotechnologies et le suivi des impacts éventuels sur la biodiversité, la diversité génétique et l'environnement. Le but ultime et de rassebler des atouts pout le développement durable.
- Sauver les palmiers au Maroc (les palmiers dattiers au Maroc sont repartis en palmeraies...)
- Contraintes (stress) biotiques et abiotique du palmier dattier(parmi les contraintes biotiques, le bayoud constitue ....)
- Le charançon rouge. Une nouvelle menace pour le palmier dattier au Maghreb. C'est sérieux, cette fois, la charançon rouge (Rhynchophorus ferrugineus, red palm weevil) attaque les palmiers au nord du Maroc.
- Biodiversité. Espèces menacées de disparition (rapport UICN 2009)
- OGM. Avantages et/ou inconvénients
-/ Microbes synthétiques pour sauver l'environnement ?


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